W wyborach samorządowych działacze organizacji uzyskali mandaty radnych.
W 2003 działacze MW i LPR pikietowali przeciwko należącemu do Langenortu statkowi, w którym załoga ułatwiała kobietom aborcję przy zaistnieniu przesłanek niedopuszczonych przez polskie prawo. Protestujący podjęli próbę blokady portu we Władysławowie. W dniu Narodowego Święta Niepodległości w Warszawie odbyła się uroczysta konferencja pod hasłem „Rola ruchu narodowego w odzyskaniu niepodległości”, a po jej zakończeniu kilkaset osób przemaszerowało ulicami stolicy. Konferencja była częścią obozu, który odbył się w Falenicy. Powstała Akademia Orła, która przygotowywała Wszechpolaków do udziału w życiu społeczno-politycznym kraju.
Podczas referendum akcesyjnego do Unii Europejskiej MW krytykowała wstępowanie do tej organizacji międzynarodowej i namawiała do głosowania przeciwko wstępowaniu. 1 maja 2004 współorganizowała Marsz Niepodległości. W 2004 prezesem został wybrany Radosław Parda. W wyborach do Parlamentu Europejskiego w 2004 roku kilku ówczesnych i byłych jej członków zdobyło mandaty (m.in. Wojciech Wierzejski i Sylwester Chruszcz).
W 2005 MW razem z Ligą Polskich Rodzin i Obozem Narodowo-Radykalnym zorganizowała Marsz Normalności w Warszawie, w którym wzięło udział 2 tysiące osób.