Dzięki stosowaniu tej miary można między innymi: szacować wielkość projektu informatycznego, szacować potrzebne zasoby określać wydajność produkcji oprogramowania – na przykład poprzez mierzenie liczby punktów funkcyjnych wytworzonych podczas tygodnia szacować koszty potrzebne do zmiany wprowadzanej do istniejącego systemu informatycznego porównywać oprogramowanie pod względem wielkości/złożoności.
Przykładowo można szacować, że 1 PF to około 8 godzin pracy w technologii 3GL lub 1,5 godziny w technologii 4GLBeata Czarnacka-Chrobot, Pomiar rozmiaru funkcjonalnego systemu informatycznego – sposób na „chaos permanens”, PTI, Mrągowo, 2004, dostępne w Internecie, dostęp 2008-06-25, 18:12:12. lub według innych danych – odpowiednio 17 i 11 godzinCapers Jones, Programming Languages Table, release 8.2, Software Productivity Research, Inc., 1996..
Analizę punktów funkcyjnych można również stosować jako metodę ustalania kosztu testowania systemu informatycznego. Według CapersaEstimating Software Costs – T. Capers Jones. liczba wymaganych przypadków testowych jest równa sumie punktów funkcyjnych podniesionej do potęgi 1,2.