W lipcu 2026 zakończył współpracę z tygodnikiem „Sieci” (poprzednio „W Sieci”) po odmowie opublikowania jego tekstu Zatrzymać Czarnka, w którym ostro skrytykował antyukraińską retorykę przedstawianego przez PiS jako kandydata na premiera Przemysława Czarnka; artykuł ostatecznie opublikowała „Rzeczpospolita”).
W 2013 komornik zajął jego wynagrodzenie za pracę na uczelni, co było konsekwencją przegranego przez niego w 2010 procesu z byłym komendantem głównym policji Konradem Kornatowskim. W tym samym roku Jan Rokita został wykluczony z PO przez jej zarząd krajowy z powodu niepłacenia składek członkowskich.
Wziął udział w konwencji Polski Razem przed wyborami do Parlamentu Europejskiego w 2014 i zadeklarował głos na kandydatkę tej formacji Jadwigę Emilewicz. W tym samym roku wszedł do komitetu poparcia Marka Lasoty, kandydującego na prezydenta Krakowa. W kolejnych latach deklarował głos na kandydatów Prawa i Sprawiedliwości (w wyborach samorządowych 2018 na Małgorzatę Wassermann i w wyborach parlamentarnych 2019 na startującego do Senatu Krzysztofa Mazura).