W 2020 roku miasto szczególnie ciężko odczuło pandemię COVID-19, która przeciążyła lokalny system ochrony zdrowia i służby komunalne.
Administracja i podział terytorialny mały|Zabudowa Guayaquil po wielkim pożarze z 1896 roku Guayaquil jest zarządzane przez samorząd miejski właściwy dla kantonu Guayaquil, działający w ramach ekwadorskiego systemu zdecentralizowanych władz autonomicznych. Pod względem administracyjnym kanton dzieli się na 16 parafii miejskich i 5 parafii wiejskich. Granice czternastu parafii miejskich wytyczono w 1956 roku, a Pascuales i Chongón przeniesiono z kategorii parafii wiejskich do miejskich odpowiednio w 2008 i 2010 roku. Urząd burmistrza piastuje wybrany w 2023 roku , jednak od marca 2026 roku, ponieważ Álvarez czasowo nie może sprawować urzędu, obowiązki burmistrza pełni wiceburmistrzyni Tatiana Coronel, a jej zastępstwo rada miejska zatwierdziła 26 marca 2026 roku. Podział terytorialny Ekwadoru opiera się na regionach, prowincjach, kantonach i parafiach wiejskich, a zakres kompetencji władz lokalnych określa (COOTAD), kodeks regulujący funkcjonowanie jednostek zdecentralizowanych.