Stefan Reuter (ur. 16 października 1966 w Dinkelsbühl) – były niemiecki piłkarz występujący na pozycji pomocnika.
Kariera klubowa Reuter treningi rozpoczął w klubie TSV 1860 Dinkelsbühl. W 1982 roku trafił do juniorskiej ekipy zespołu 1. FC Nürnberg. W 1984 roku został włączony do jego pierwszej drużyny, grającej w 2. Bundeslidze. W 1985 roku awansował z nim do Bundesligi. W tych rozgrywkach zadebiutował 10 sierpnia 1985 roku w przegranym 0:1 meczu z VfL Bochum. 21 września 1985 roku w wygranym 3:1 pojedynku z 1. FC Kaiserslautern strzelił pierwszego gola w trakcie gry w Bundeslidze. W pierwszej drużynie 1. FC Nürnberg spędził 4 lata.
W 1988 roku Reuter odszedł do Bayernu Monachium, również grającego w Bundeslidze. Pierwszy ligowy mecz zaliczył tam 23 lipca 1988 roku przeciwko Eintrachtowi Frankfurt (3:0). W 1989 roku oraz w 1990 roku zdobył z klubem mistrzostwo RFN, a w 1991 roku wywalczył z nim wicemistrzostwo Niemiec.