Od 1818 roku na terenie diecezji znalazł się Kalisz ze swoim sanktuarium św. Józefa. Łaskami słynący obraz Świętej Rodziny, gdzie św. Józef był szczególnie czczony, został ozdobiony koronami papieskimi już w 1796 roku. To zdaniem historyków było przyczyną obrania tego świętego za patrona diecezji. Dzięki staraniom bpa Wincentego Popiela, w 1880 roku Stolica Apostolska wydała dekret ustanawiający głównym patronem diecezji św. Józefa. Sanktuarium św. Józefa znajduje się we Włocławku. Drugim patronem został obrany błogosławiony Bogumił z Dobrowa.
Sanktuaria mały|sanktuarium i bazylika Najświętszej Maryi Panny Licheńskiej w Licheniu Starym mały|Sanktuarium Urodzin i Chrztu św. Faustyny w Świnicach Warckich rejon koniński sanktuarium bł. Bogumiła w Dobrowie sanktuarium Przemienienia Pańskiego w Galewie sanktuarium Matki Bożej Bolesnej Królowej Polski w Licheniu Starym sanktuarium Matki Bożej Bolesnej w Skulsku sanktuarium Urodzin i Chrztu św. Siostry Faustyny w Świnicach Warckich rejon sieradzki sanktuarium Matki Bożej Księżnej Ziemi Sieradzkiej w Charłupii Małej sanktuarium św. Maksymiliana Kolbe w Zduńskiej Woli sanktuarium św.