Okres końcowy 19 czerwca 1990 przewodniczący komisji Kroll przesłał do redaktorów „Gazety Wyborczej”, „Rzeczpospolitej” i „Życia Warszawy” oraz do Polskiej Agencji Prasowej notatkę z prac komisji. 20 czerwca „Gazeta Wyborcza” opublikowała artykuł Akta warte historii, informując, że komisja żąda dodatkowej weryfikacji zbiorów archiwalnych MSW przez komisje złożone z przedstawicieli MSW, archiwów państwowych i uniwersyteckiego środowiska naukowego. Tekst stwierdzał, że komisja dopilnuje ochrony akt przez zniszczeniem. Kroll zwrócił uwagę Michnikowi w napisanym tego samego dnia liście, że zabezpieczenie dokumentacji leży wyłącznie w gestii MSW:
Komisja zakończyła działalność 27 czerwca 1990 składając kilkustronicowy raport końcowy zatytułowany Sprawozdanie i wnioski, który wnioskował o powołanie komisji do szczegółowej oceny zasobu MSW na szczeblu centralnym i wojewódzkim, a także o przekwalifikowanie części dokumentacji niearchiwalnej do kategorii A i przedłużenie okresu przechowywania innej jej części, wskazując przykłady proponowanych zmian w załączniku. Raport ponowił żądanie przekazania przez MSW do archiwów państwowych wszystkich materiałów o pozaresortowej proweniencji. Spośród członków komisji sprawozdania nie podpisał Holzer.