Ze względu na koszty projekt nie został wykonany w pełnym zakresie i ograniczano się głównie do robót zabezpieczających.
Wojny XVII wieku
Inwentarz z 1645 roku przedstawia zamek jako obiekt poważnie zaniedbany. Uszkodzone były dachy, ganki, wieże i część pomieszczeń, a uzbrojenie było stosunkowo skromne.
Podczas powstania Chmielnickiego w 1648 roku wojska kozackie dowodzone przez Maksyma Krzywonosa zaatakowały Wysoki Zamek i po walkach na pewien czas opanowały warownię, ale nie zdołały zdobyć miasta. Zdobycie zamku oraz zniszczenia będące następstwem walk pozbawiły zamek na kilka lat zdolności obronnej.
Po objęciu starostwa lwowskiego przez Jana Mniszcha w 1653 roku przystąpiono do odbudowy zamku. Prace prowadzono w okresie, w którym władze Rzeczypospolitej przywiązywały szczególne znaczenie do fortyfikacji Lwowa. Część środków pochodziła ze skarbu koronnego, a bezpośredni nadzór wojskowy nad restauracją sprawował generał artylerii koronnej Krzysztof Grodzicki. Naprawiono mury, baszty, blanki, bramy i zabudowania, oczyszczono i wycembrowano studnię, a dostępniejsze odcinki wzmacniano przekopami i ostrokołem.