Główny ruch pieszy został skierowany przez pasaże handlowe prowadzące do podziemnego dworca.
Budowa podziemnego dworca, zlokalizowanego bezpośrednio pod peronami, napotykała na liczne problemy wykonawcze i organizacyjneDworzec – prace trwają, ale będzie poślizg.. Otwarcie obiektu, pierwotnie planowane na 2012–2013Rośnie podziemny Kraków | krakownowyglowny.pl., zostało kilkakrotnie przełożoneHistoria | krakownowyglowny.pl.Co nowego w podziemnym Krakowie? | krakownowyglowny.pl.. W związku z odstąpieniem przez PKP SA od umowy zawartej z wykonawcą, który ogłosił upadłość we wrześniu 2012, termin został wstępnie ustalony na IV kwartał 2013 roku. 13 lutego 2013 PKP SA ogłosiły, że komisja inwentaryzacyjna oceniająca zaawansowanie inwestycji stwierdziła, że nowemu wykonawcy potrzebne będzie co najmniej osiem miesięcy, aby ją zakończyć. Ponieważ ogłoszenie przetargu miało nastąpić najwcześniej w marcu, termin otwarcia miał nie być wcześniejszy niż w 2014 roku. 12 lipca 2013 ogłoszono ponadto, że zakończenie remontu przewidziane jest na grudzień tegoż roku. Ostatecznie nowy, podziemny dworzec oddano do użytku 14 lutego 2014 roku.