Na przełomie września i października Selbstschutz został podporządkowany Kurtowi Daluegemu co wymusiło na Alvenslebenie sporządzanie list aresztowanych, a decyzje o ich losie zapadały na naradach z dowódcami powiatowymi. Alvensleben podczas spotkań zachęcał podwładnych do zwiększenia skali terroru i rozstrzeliwań, a niespełniających oczekiwań (np. standartenführer SS Norbert Scharf z inspektoratu w Starogardzie Gdańskim) zwalniał ze stanowisk.
Działania Selbstschutzu budziły sprzeciw nawet wśród niemieckiej armii, w połowie października 1939 r. gen. interweniował w sprawie masowych rozstrzeliwań Polaków na obszarach pozostających we władzy Alvenslebena. Nie przyniosło to efektu, gdyż jego działania były w pełni aprobowane przez Himmlera, który 20 października wizytował Bydgoszcz. Alvensleben, podczas egzekucji Polaków w obecności Himmlera, osobiście dobijał rozstrzeliwanych. Ostatecznie, na skutek działań podejmowanych przez Alberta Forstera, dochodzi do rozwiązania Selbschutzu. Alvensleben został zobowiązany do przekazania dokumentacji działalności podległych mu struktur gauleiterowi Forsterowi, jednakże samochód przewożący dokumenty spłonął na skutek wypadku. Podczas uroczystego rozwiązania Selbschutzu Alvensleben został odzanczony za swą działalność Krzyżem Gdańskim.