Start nastąpił 26 października 2006 o godzinie 00:52 UTC. Został opóźniony o 14 minut (prawie do końca okna startowego), z powodu za niskiej temperatury zbiornika ciekłego azotu 1. stopnia rakiety oraz wiatru mogącego spowodować, w przypadku katastrofy rakiety, zwianie trujących oparów na teren kosmodromu. Niecałe dwie godziny później, o 02:42 UTC, statki pomyślnie skomunikowały się z Ziemią potwierdzając rozłączenie się i swój dobry stan techniczny.
„Pierwsze światło” (pierwsze zdjęcia) z teleskopu SEECHI na sondzie STEREO-A uzyskano 4 grudnia 2006. O ich jakości naukowcy z NASA mówili „Jesteśmy bardzo poruszeni. Czekaliśmy na realizacje wyjątkowej misji STEREO przez ponad 10 lat. Społeczność naukowa nie może być szczęśliwsza widząc te pierwsze obrazy”Wypowiedź Michaela Kaisera, naukowca projektu STEREO, z Goddard Space Flight Center .
Cele naukowe thumb|250px|Sondy STEREO uzyskają trójwymiarowe zdjęcia Słońca dzięki nakładaniu się pól widzenia ich przyrządów naukowych
Zrozumienie przyczyn i mechanizmów powstawania koronalnych wyrzutów masy Opisanie rozchodzenia się koronalnych wyrzutów masy w obrębie heliosfery Odkrycie mechanizmów i miejsc przyspieszania cząstek energetycznych w dolnej koronie i w ośrodku międzyplanetarnym Dokładniejsze niż do tej pory określanie składu wiatru słonecznego