W XVIII wieku rozwinął się w Brnie przemysł tkacki, który pozwolił miastu zdystansować w rozwoju konkurencyjny ośrodek Moraw, Ołomuniec. Od tej pory trwał tu intensywny rozwój przemysłowy z zastosowaniem pionierskich w obszarze monarchii habsburskiej wynalazków (1814 – pierwsza maszyna parowa). Dopiero w 1805 roku miasto poddało się po raz pierwszy, ulegając wojskom francuskim Napoleona Bonaparte. W 1805 roku w pobliżu miasta rozegrała się bitwa pod Austerlitz, w której walczyły armie austriacka i rosyjska z jednej strony, a armia francuska cesarza Napoleona z drugiej. Napoleon Bonaparte odwiedził Brno dwukrotnie w tym roku: od 20 listopada 1805 roku przebywał tam do nocy 29 listopada, a po zwycięstwie ponownie od 7 do 12 grudnia. We wrześniu 1809 roku powrócił do miasta, gdzie jego armia czekała na niego od 13 lipca. Cesarz Napoleon I nakazał zniszczyć częściowo fortyfikacje miejskie, by nie stały się oparciem dla jego przeciwników. W połowie XIX wieku pierścień murów miejskich rozebrano, a teren wokół twierdzy splantowano. W efekcie tych działań do dziś zachowała się tylko jedna brama miejska z siedmiu, które niegdyś istniały. Niemniej jednak Špilberk nadal pełnił funkcje publiczne – jako ciężkie więzienie (w tym polityczne) – aż do 1853 roku.