Z zebraniem apostołów bezpośrednio związany był konflikt antiocheński. Miał on miejsce w Antiochii i dotyczył wspólnoty stołu judeochrześcijan i poganochrześcijan. Pod naciskiem Żydów przysłanych przez Jakuba, Piotr postanowił zastosować się do Prawa Mojżeszowego i przestał jadać z poganochrześcijanami. Dołącza do niego także Barnaba, wobec czego Paweł pozostał jedynym, który je wspólnie z chrześcijanami z pogan. Postawa Piotra była najprawdopodobniej spowodowana obawą o utratę jedności Kościoła. Możliwe, że konflikt ten został zażegnany po wprowadzeniu kompromisowych klauzuli Jakubowych. Było to ostatnie spotkanie Piotra z Pawłem, a Kefas pozostał przez dłuższy czas w Antiochii.
Rzym i śmierć mały|Ukrzyżowanie św. Piotra pędzla Michała Anioła Caravaggio Po pewnym czasie (po 51/52 roku) udał się do Rzymu. Wzmianki o jego działalności w Poncie, Kapadocji, Galacji i Azji Mniejszej należy odrzucić. Informacja o dwudziestopięcioletnim pobycie w Rzymie jest III-wieczną legendą.