Sezon 2006/2007 był pierwszym, w którym zespół seniorów występował w ekstraklasie, pokonując między innymi Prokom Trefl Sopot (mistrz Polski), Śląsk Wrocław czy Polpharmę Starogard Gdański. Przygoda z elitą potrwała jednak tylko rok, chociaż do utrzymania zabrakło naprawdę niewiele. Jarosławianie przegrali batalię z Polonią Warszawa jedynie gorszym stosunkiem małych punktów w bezpośrednich meczach. Znicz prowadziło w tym okresie dwóch szkoleniowców – początkowo Stanisław Gierczak, a w końcówce Serb – Miodrag Gaić. W sezonie 2007/2008 przed zespołem postawiono cel powrotu do ekstraklasy. Początkowo drużyna, której trenerem został stalowowolanin Bogusław Wołoszyn spisywała się dość przeciętnie. Ale gdy zespół przejął Stanisław Gierczak, zaczęła gonić czołówkę. Do decydującej batalii w play-off Znicz przystąpił z 4 miejsca. W pierwszej rundzie po zaciętej rywalizacji, trapiona kontuzjami jarosławska ekipa poradziła sobie z innym faworytem ligi – drużyną Politechniki Poznań, a w półfinale ograła Stal Stalową Wolę i po raz drugi w historii świętowała awans. Tym razem przed własną, ponad półtoratysięczną publicznością.