Następnie Hanza straciła wpływy w Danii i Inflantach, a w 1598 roku królowa Anglii Elżbieta I Tudor wyrzuciła z kraju wszystkich kupców hanzeatyckich, oprócz przedstawicieli Gdańska. Ostatecznie Hanza utraciła pozycję w wyniku wielkich odkryć geograficznych i ustanowienia szlaków morskich łączących Europę z Ameryką i Indiami oraz przywozu dużej ilości kruszców do bicia monet.
Ostatni zjazd delegatów miast hanzeatyckich odbył się w 1669 roku i wzięło w nim udział tylko sześć miast (Lubeka, Brema, Gdańsk, Hamburg, Kolonia i Brunszwik), jednak sama organizacja oficjalnie nie została zlikwidowanaOd imperium Karola Wielkiego do kryzysu XIV wieku. T. 8. Madrid, Kraków: Mediasat Group, 2007, seria: Biblioteka Gazety Wyborczej. Historia Powszechna. ..
Miasta należące do Hanzy W celu lepszego funkcjonowania Hanzy, podzielono ją na 4 grupy (niem. Quartiere): Wendyjską, w skład której wchodziły strefy wendyjska i pomorska Saską, w skład której wchodziły strefy saksońska i brandenburska (lub saksońska) Bałtycką (lub prusko-inflancką), która składała się ze stref pruskiej, liwońskiej i szwedzkiej (lub wschodniobałtycka) Westfalską (lub nadreńską), w skład której wchodziły strefy westfalska i niderlandzka (lub reńska, od rzeki Ren)