Osady denne gromadzą substancje dostarczane przez rzekę, spływ powierzchniowy i procesy biologiczne zachodzące w zbiorniku.

Gospodarka wodna Zbiornik pełni kilka podstawowych funkcji:

magazynowanie wody przeznaczonej do uzdatniania; wyrównywanie przepływów Brynicy; ochrona przeciwpowodziowa; utrzymywanie rezerwy wody dla regionalnego systemu wodociągowego; ograniczanie skutków okresowych wezbrań; funkcja przyrodnicza i krajobrazowa.

Gospodarowanie wodą wymaga pogodzenia interesów wodociągowych, przeciwpowodziowych i przyrodniczych. Obniżanie poziomu wody może prowadzić do odsłaniania rozległych fragmentów dna, natomiast wysokie piętrzenie wpływa na zalewanie stref szuwarowych i siedlisk ptaków.

Zbiornik jest zarządzany w powiązaniu z działalnością Górnośląskiego Przedsiębiorstwa Wodociągów i regionalnym systemem gospodarki wodnej.

Jakość wody i procesy limnologiczne Kozłowa Góra jest zbiornikiem podatnym na eutrofizację ze względu na niewielką średnią głębokość, dużą powierzchnię, dopływ substancji biogennych ze zlewni oraz intensywne procesy biologiczne.

Do głównych czynników wpływających na jakość wody należą: