Trafił do Fortuny Köln, grającej na zapleczu ekstraklasy. Szybko wywalczył tam sobie miejsce w pierwszej jedenastce. Łącznie grał tam przez trzy sezony. W trakcie występów dla tego klubu, nie odniósł z nim większych sukcesów. W sumie zagrał tam 80 razy i zdobył 24 bramki.
W 1999 roku podpisał kontrakt z pierwszoligowym Bayerem 04 Leverkusen. Zadebiutował tam w meczu Pucharu Ligi Niemieckiej z 1. FC Kaiserslautern, wygranym przez Bayer 3-1. Już w pierwszym sezonie udało mu się wywalczyć z klubem wicemistrzostwo Niemiec. W 2002 roku ponownie zajęli drugie miejsce w Bundeslidze. W tym samym roku dotarli do finału Pucharu Niemiec, w którym ulegli 2-4 FC Schalke 04. Zostali także finalistami Ligi Mistrzów, gdzie zostali pokonani przez Real Madryt 2-1. W 2003 roku został wypożyczony do Hannoveru 96. Przez cały sezon strzelił dwanaście goli, co było najlepszym osiągnięciem wśród zawodników H96. Jednak po zakończeniu rozgrywek ligowych, włodarze hanowerskiej drużyny nie postanowili wykupić Brdaricia. W tej sytuacji Bayer za milion euro sprzedał go do VfL Wolfsburg.