Skałki Przegorzalskie 1,38 ha skała z roślinnością kserotermiczną Skołczanka 36,77 ha zrębowe wzgórze wapienne ze zróżnicowanymi biocenozami, stanowisko fauny środowisk kserotermicznych, w tymrzadkich i zagrożonych gatunków owadów
W Krakowie znajduje się 362 pomniki przyrody, w tym aleja drzew, źródło „Świętojańskie” w Tyńcu, głaz narzutowy granit czerwony „Rapa Kiwi” (stan na 2023 rok).
Użytki ekologiczne
mały|Widok Krakowa w kierunku północnym. Na pierwszym planie Wawel z katedrą i zamkiem, dalej Stare Miasto z wieżą ratuszową i kościołem Mariackim. W głębi zabudowania Kleparza oraz osiedla Krowodrza Górka i Prądnik Biały|alt=Zdjęcie lotnicze. Panorama miasta od strony Wawelu. Na pierwszym planie zamek z czerwonymi dachami, ściany w kolorze jasno żółtym. Za nim po lewej stronie widać katedrę z wieżami. Najwyższa Zegarowa, z miedzianym (zielonkawym) dachem wznosi się ponad ciemnobrązowym dachem katedry. Obok niej ceglana z podstawą z białego kamienia wapiennego, z dachem w kształcie ostrosłupa. Przylegają do niej dwie niższe wieże z miedzianymi dachami. Po jej prawej stronie błyszczy złota kopuła na Kaplicy Zygmuntowskiej. Po drugiej stronie katedry wznosi się pokryta miedzianym dachem Wieża Zygmuntowska.