Pod koniec eocenu pierwotne konie wyginęły w Europie, natomiast w Ameryce Północnej ich linia rozwojowa była kontynuowana.

Mesohippus późny eocen – wczesny oligocen około 38–32 mln lat temu

W Europie w oligocenie pojawiły się Mesohippus, osiągające już około 50 cm wysokości w kłębie. Gatunek ten był lepiej przystosowany do szybkiego biegu. Proces redukcji bocznych palców postępował dalej, choć nadal miały one znaczenie funkcjonalne. Posiadał po trzy palce na każdej kończynie, z wyraźnie dominującym palcem środkowym, oraz doszło do redukcji piątego palca do szczątkowej pozostałości. Miał także dłuższe kończyny i silniej rozwinięte uzębienie. Równolegle rozpoczęło się upodobnianie przedtrzonowców do trzonowców. Mózg uległ znacznemu powiększeniu w stosunku do Hyracotherium, niezależnie od zmian wielkości ciała, które osiągało około 20 kg.

thumb|Zestawienie na podstawie szkieletów ze zbiorów Państwowego Muzeum Przyrody w Karlsruhe (Niemcy). Od lewej do prawej: zmiany wielkości ciała, biometryczne zmiany czaszki, redukcja palców (lewa kończyna przednia). Miohippus późny eocen – wczesny miocen około 36–25 mln lat temu