11 maja wygrał Puchar Włoch, ponownie pokonując drużynę Juventusu, tym razem 4:2. W sezonie 2021/2022 uplasował się na 2. pozycji w tabeli ligowej, a w rozgrywkach Ligi Mistrzów odpadł na etapie 1/8 finałów, przegrywając 1:2 w dwumeczu z Liverpoolem.
Sezon 2022/2023 mały|331x331px|Inzaghi razem z asystentem Massimiliano Farrisem (2023) Sezon 2022/2023 rozpoczął od wygrania 2:1 w meczu z Lecce. W fazie grupowej grupy C Ligi Mistrzów, Inter zajął 2. miejsce premiowane awansem, za Bayernem Monachium, a przed Barceloną i Viktorią Pilzno.
Rok 2023 Inzaghi rozpoczął od wygrania 1:0 z Napoli. 18 stycznia w ramach Superpucharu Włoch, Inter zmierzył się z Milanem, którego pokonał 3:0, triumfując w tych rozgrywkach po raz drugi z rzędu. Podczas 1/8 finału Ligi Mistrzów, Inter pokonał w dwumeczu 1:0 zespół Porto. W ćwierćfinale włoski zespół ponownie zmierzył się z portugalską drużyną – Benficą. Inzaghi najpierw wygrał pierwszy mecz 2:0, a w drugim spotkaniu padł remis 3:3 i tym samym Inter po raz pierwszy od 13 lat awansował do półfinału. Tam pokonał w dwumeczu Milan 3:0 (2:0 i 1:0). 3 maja Inzaghi zanotował swój 100. mecz w roli trenera drużyny, który Inter wygrał 6:0 z Hellasem Veroną. 10 czerwca Inter wystąpił w finale europejskich rozgrywek przeciwko Manchesterowi City.