pozycji z 78 punktami i tym samym po raz pierwszy od sezonu 2007/2008 awansowało do Ligi Mistrzów UEFA. Sezon 2020/2021 rzymski klub zakończył na 6. miejscu w tabeli Serie A. W rozgrywkach Ligi Mistrzów UEFA Lazio awansowało z fazy grupowej do 1/8 finału, w której odpadło, przegrywając 6:2 w dwumeczu (1:4 w pierwszym meczu, 1:2 w drugim) z Bayernem Monachium. W Pucharze Włoch drużyna dotarła do ćwierćfinału, w którym przegrała 2:3 z Atalantą.
W maju 2021 poinformowano, że Inzaghi przestanie pełnić funkcję szkoleniowca drużyny Lazio, którą poprowadził w 244 meczach, zwyciężając w 131 spotkaniach, remisując 43 razy, a przegrywając w 70 meczach.
Inter Mediolan Sezon 2021/2022 27 maja 2021, niedługo po oficjalnym rozstaniu się Inzaghiego z Lazio, media poinformowały o przejściu trenera do Interu Mediolan, zastępując zwolnionego Antonio Conte. 3 czerwca klub potwierdził te doniesienia, podpisując z Inzaghim dwuletni kontrakt. Jako szkoleniowiec zadebiutował 21 sierpnia, a Inter pokonał 4:0 zespół Genoi. W swoim pierwszym meczu Ligi Mistrzów UEFA rozegranym przeciwko Realowi Madryt przegrał 1:0. Jednak w kolejnym meczu, który Inter rozegrał 18 września przeciwko Bolognii, rozgromił rywali 6:1.
12 stycznia 2022 zdobył pierwsze trofeum jako trener Interu, pokonując 2:1 Juventus w Superpucharze Włoch.