Styl animacji również został uwspółcześniony, co oznaczało jasne kolory, duże oczy, małe usta i nosy oraz niezwykłe kolory włosów i oryginalne fryzury. Główni bohaterowie są w znacznej części bardzo młodzi, co wiąże się z wiekiem docelowej grupy animowanych serii Gundam.
Jednym z głównych tematów poruszanych przez Gundam Seed jest natura niekończącego się cyklu wojen. Ten wątek powraca kilkakrotnie i w różnych ujęciach. Może być sprowadzony do tego, że osiągnięcie pokoju nie jest możliwe, dopóki na śmierć odpowiada się śmiercią, a za jedyne możliwe zakończenie konfliktu jest uważane zniszczenie przeciwnika. Uwzględnienie w fabule problemów takich jak rasizm i dążenie do ludobójstwa dodatkowo uwspółcześniło serial i dostarczyło materiału do komentarzy społecznych i przemyśleń. Genetycznie zmodyfikowani Koordynatorzy stanowią wizję przyszłości w świecie zaangażowanym obecnie w dyskusje nad żywnością modyfikowaną genetycznie i klonowaniem.
Stopień zbieżności między Gundam Seed i oryginalną serią Gundam wzbudził wiele kontrowersji w środowisku fanów. Część z nich krytykowała skupienie się na relacjach między bohaterami kosztem szerszego obrazu wojny oraz styl animacji, bardziej poszarpany niż we wcześniejszych seriach.