Ponadto wraz ze swoim klubem zdobył Puchar Ligi, Puchar UEFA, zaś w sierpniu Tarczę Wspólnoty. W spotkaniu o Superpuchar Europy z Bayernem Monachium Heskey zdobył bramkę, a mecz zakończył się zwycięstwem Liverpoolu 3:2.
„Niektórzy lubią krytykować Emile’a, jednakże mogę przedstawić kilka faktów i liczb, aby udowodnić, jak jest dla nas ważny i jak wiele bramek zdobyliśmy z jego udziałem.” – Gérard Houllier
W grudniu 2002 roku Heskey był łączony z przejściem do Tottenhamu Hotspur, Houllier oświadczył jednak, że piłkarz jest częścią jego długoterminowych planów i pozostanie w klubie. Tego samego roku Anglik dał darowiznę na pomoc konsorcjum prowadzonemu przez Gary’ego Linekera na wykupienia jego byłego klubu, Leicesteru City, który doświadczył kłopotów finansowych. W sezonie 2002/2003 zdobył on dziewięć bramek w 51 rozegranych spotkaniach we wszystkich rozgrywkach. Został również skrytykowany za swoją niską średnią goli na mecz, Houllier utrzymywał jednak, że jego przyszłość w drużynie jest bezpieczna. Zdobył także ze swoim klubem po raz drugi Puchar Ligi