Część wyników badań, w których obserwowano działanie prozapalne w przewodzie pokarmowym, dotyczyła materiału o obniżonej masie cząsteczkowej lub ekspozycji odbiegającej od typowego spożycia z dietą. W publikacjach popularnonaukowych zwraca się uwagę, że część kontrowersji w odbiorze społecznym wiąże się z myleniem karagenu spożywczego z poligeenanem.

Karagen w przewodzie pokarmowym Z danych dotyczących ADME (wchłanianie, dystrybucja, metabolizm i wydalanie) wynika, że wysokocząsteczkowy karagen (typowy dla dodatku do żywności) nie jest wchłaniany w dostarczonej postaci, czyli organizm nie traktuje go jak składnika odżywczego. W żywności pełni przede wszystkim rolę składnika strukturotwórczego (wpływającego na teksturę i wilgotność). EFSA zwracał też uwagę, że część doświadczeń in vivo, w których karagen podawano zwierzętom w wodzie do picia, ma ograniczoną przydatność do praktycznej oceny narażenia, ponieważ karagen zwykle współwystępuje w żywności i może wiązać się z białkami (jest składnikiem struktury produktu, a nie „czystym roztworem” używanym w doświadczeniach).