VI i ostatnia generacja Mazdy 323 o oznaczeniu BJ pojawiła się w sierpniu 1998. Wydanie tej wersji poprzedzono w dwóch wersjach nadwoziowych: 5-drzwiowy hatchback i 4-drzwiowy sedan. 323F zerwała stylistycznie ze swoimi poprzednikami, które swoim wyglądem przypominały sportowe coupé. Jednocześnie w latach 1997–2001 była produkowana 3 drzwiowa Mazda 323P hatchback o oznaczeniu BA, która od 1998 r. wraz z silnikiem Diesla o pojemności 2,0 l, dostała oznaczenie BJ. Generacja BJ charakteryzuje się stonowaną sylwetką, jak na kompaktowe auto. Przełomowy bak o pojemności 92 litrów paliwa.
Auto otrzymało trzy silniki benzynowe: 1.3 73 KM (B3), 1.5 88 KM (ZL), 1.8 GT 114 KM (FP) oraz silnik Diesla 2.0 DITD o mocy 90 KM (RF2A). Auto było dość bogato wyposażone m.in. poduszka powietrzna kierowcy w standardzie, ABS, elektrycznie otwierane szyby czy lusterka.
W 2001 po 2,5 roku produkcji zdecydowano się na gruntowny lifting nadwozia i wnętrza 323 w wersji 4- i 5-drzwiowej. Facelifting upodobnił 323 do większych modeli tej marki (626 czy Premacy).