W ramach Instytutu Medycyny Morskiej i Tropikalnej Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego oraz Uniwersyteckiego Centrum Medycyny Morskiej i Tropikalnej: w zakresie medycyny morskiej: Krajowym Ośrodkiem Medycyny Morskiej – jest Klinika Chorób Zawodowych, Metabolicznych i Wewnętrznych Krajowym Ośrodkiem Medycyny Hiperbarycznej – jest Klinika Medycyny Hiperbarycznej i Ratownictwa Morskiego w zakresie medycyny tropikalnej: Krajowym Ośrodkiem Medycyny Tropikalnej – jest Katedra Medycyny Tropikalnej i Parazytologii, w której skład wchodzą: Klinika Chorób Tropikalnych i Pasożytniczych Zakład Parazytologii Tropikalnej Zakład Medycyny Tropikalnej i Epidemiologii
Drugim ośrodkiem referencyjnym w Polsce jest oddział kliniczny chorób tropikalnych i pasożytniczych Uniwersyteckiego Szpitala Klinicznego w Poznaniu, prowadzony przez Katedrę i Klinikę Chorób Tropikalnych i Pasożytniczych Wydziału Medycznego Uniwersytetu Medycznego im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu.
W ograniczonym zakresie dziedziną zajmują się także ośrodki kliniczne chorób zakaźnych w Szczecinie, Warszawie, Krakowie, Łodzi, Białymstoku i we Wrocławiu, a także Wojskowy Instytut Medyczny, Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego – Państwowy Zakład Higieny oraz Wojskowy Instytut Higieny i Epidemiologii im. gen.