Opis działania Program VirtualDub pozwala na wybór metody kompresji, zależnie od algorytmu można określić dodatkowe wartości obrazu, takie jak rozdzielczość, ilość klatek na sekundę oraz siłę kompresji. Użytkownik ma także do dyspozycji zbiór filtrów rozszerzających możliwości programu. Wśród najciekawszych pozycji wyróżnić można filtry rozmycia, obracania o ustalony kąt, przerzucania horyzontalnego i wertykalnego, zmianę rozmiaru i przycinanie obrazu, wstawianie dodatkowego obrazu statycznego w postaci loga oraz wpisywanie tekstów. Dodatkowe filtry uzupełniające funkcjonalność narzędzia można pobrać z Internetu.
Podczas dalszej obróbki można dokonać zmian w ścieżce dźwiękowej. Metodę kompresji dźwięku i jego jakość należy dopasować do standardu w jakim będzie zapisany obraz. VirtualDub daje możliwość wycięcia ścieżki dźwiękowej zmniejszając wielkość pliku wynikowego lub jej zapis w osobnym pliku audio.
Funkcją mogącą znacząco przyspieszyć pracę nad plikami jest opcja zachowywania ustawień procesu. Pozwala to na wczytywanie wcześniej przygotowanych profili przy konwersji innych filmów.