Od 16 czerwca do 28 września 2015 roku prowadził IV-ligową Mławiankę MławaPiotr Zajączkowski nie jest już trenerem Mławianki Mława na futbolowo.pl.. Pod kierunkiem Zajączkowskiego Mławianka rozegrała dziewięć oficjalnych spotkań ligowych. Pięć z nich wygrała, dwa zremisowała i tyle samo przegrała. Dziesiąte, czyli wyjazdowe spotkanie, które wygrała 9:0 w Ostrołęce zostało anulowane po tym, jak Narew wycofała się z rozgrywek na naszamlawa.pl.. 13 października 2015 roku Zajączkowski objął funkcję trenera II-ligowej Olimpii ZamrówPiotr Zajączkowski trenerem Olimpii Zambrów na 90minut.pl., którą prowadził do kwietnia 2016 roku.
Od 5 października 2016 roku Zajączkowski był trenerem III-ligowego Pelikana Łowicz, 19 kwietnia 2017 zastąpił go na tym stanowisku Grzegorz Wesołowski.
18 lipca 2017 roku Zajączkowski objął ponownie funkcję trenera III-ligowej Drwęcy NML zastępując na tym stanowisku Sławomira Majaka. Po rundzie jesiennej jego podopieczni, uplasowali się na siódmym miejscu w tabeli. Następnie mimo bardzo trudnej sytuacji, bo ze sponsorowania klubu w przerwie zimowej wycofał się jego główny sponsor czego konsekwencją było odejście wielu doświadczonych i kluczowych zawodnikówRozpada się Drwęca Nowe Miasto Lubawskie na lodzkifutbol.pl.Drwęca po pierwszym sparingu.