W 1945 podczas II wojny światowej, wycofujące się oddziały wojsk hitlerowskich wysadziły mosty na Odrze Zachodniej i Odrze Wschodniej, by utrudnić Armii Czerwonej atak okrążający na Szczecin.
Po II wojnie światowej Kilka lat po wojnie odbudowano mosty północnych jezdni autostrady nad Odrą Zachodnią i Odrą Wschodnią, umożliwiając tym samym ruch w kierunku przejścia granicznego w Kołbaskowie. Do lat 80. autostrada stanowiła część tras europejskich E14 na odcinku Szczecin Kijewo – Rzęśnica oraz E74 na odcinku Szczecin Kijewo – Kołbaskowo (granica państwa). Od połowy lat 90. XX wieku trwała gruntowna renowacja poszczególnych odcinków A6: w latach 1997–2001 sukcesywnie oddawano do ruchu kolejne odcinki drogi, odbudowano mosty w ciągu południowych jezdni nad Odrą Zachodnią i Odrą Wschodnią, wyremontowano obiekty inżynierskie, wymieniono zużytą betonową nawierzchnię. Obecnie, pomimo braku telefonów alarmowych, droga posiada status autostrady na długości początkowych niemal 22 km od byłego przejścia granicznego w Kołbaskowie. Na odcinku długości ok.