Mimo żądań jego ekstradycji do Australii, rząd Somare 10 października 2006 zadecydował o potajemnym przetransportowaniu go i przekazaniu władzom Wysp Salomona"Moti under arrest in Solomon Islands", AbC News Online, 10 października 2006., co wywołało oburzenie rządu Australii i zamrożenie dwustronnych stosunków dyplomatycznych"Australia, PNG to 'restore' relationship", The Age, 13 grudnia 2007..
Michael Somare jako szef rządu poważnie zaangażował się w problem ochrony środowiska naturalnego, w tym zwłaszcza ochrony lasów tropikalnych. Z jego inicjatywy w maju 2005 powołano do życia Koalicję Państw Lasów Tropikalnych (Coalition for Rainforest Nations), międzyrządową organizację, której celem jest godzenie ochrony lasów z rozwojem gospodarczym. W listopadzie 2007 poparł i podpisał Forests Now Declaration, wzywającą do ochrony lasów tropikalnych w warunkach funkcjonowania wolnego rynku.