Szkoła została zamknięta w wyniku przejęcia władzy przez Dyrektoriat, jednak ta pierwsza école normale posłużyła za fundament, gdy w 1808 roku Napoleon I powołał szkołę do życia po raz drugi.
17 marca 1808 roku Napoleon na mocy dekretu utworzył pensionnat normal w ramach cesarskiego Uniwersytetu Francuskiego, którego zadaniem było „szkolenie w sztuce nauczania nauk ścisłych i humanistycznych”Ustawa z 10 maja 1806 r. dotycząca utworzenia Uniwersytetu Cesarskiego, art. 118.. Placówka została otwarta w 1810 roku, a jej rygorystyczny regulamin obejmował m.in. obowiązkowe umundurowanie. W międzyczasie Napoleon utworzył siostrzaną placówkę w Pizie pod nazwą Scuola Normale Superiore (SNS), która istnieje do dziś i wciąż utrzymuje bliskie relacje ze szkołą paryską. Do 1818 roku studenci byli starannie dobierani przez inspektorów akademickich na podstawie ich wyników w szkole średniej. Jednakże w okresie Restauracji utworzony przez Napoleona „pensionnat” zaczął być postrzegany jako ośrodek myśli liberalnej i w 1824 roku został zlikwidowany przez ówczesnego ministra edukacji publicznej, Denisa-Luca Frayssinousa.
Ponowne utworzenie mały|Główne wejście do ENS przy rue d'Ulm.