Nazwa W swojej historii Borek zwany był też jako Boreck (1784 r.). Ze względu na swoje polskie pochodzenie w 1936 nazwa Borek została zmieniona przez nazistowską administrację III Rzeszy na nową, całkowicie niemiecką nazwę Waldwinkel. 1 czerwca 1948 nadano miejscowości, wówczas administracyjnie związanej ze Ściborowicami i należącej do powiatu prudnickiego, polską nazwę BorekRozporządzenie Ministrów Administracji Publicznej i Ziem Odzyskanych z dnia 1 czerwca 1948 r. o przywróceniu i ustaleniu urzędowych nazw miejscowości ()..
Historia mały|lewo|Borek wśród miejscowości ziemi prudnickiej na mapie z XIX wieku Najwcześniejsza wzmianka o miejscowości pochodzi z 1720 r., a pierwszym, powstałym w niej budynkiem, miała być leśniczówka. W 1730 r. istniał już folwark, który w 1784 r. należał do von Oppersdorffów. Za ich czasów miejscowość przeżywała okres rozbudowy. Do 1742 wieś należała do powiatu sądowego głogóweckiego w Monarchii Habsburgów. Po I wojnie śląskiej znalazła się w granicach Królestwa Prus i weszła w skład powiatu prudnickiego w prowincji Śląsk.
W okresie germanizacji, w 1824 w Borku działała nielegalna szkoła prywatna, w której prowadzono naukę wyłącznie w języku polskim (podobna szkoła istniała wcześniej w Prudniku).