Grupa B Poz Klub Mecze Zw Rem Por Pkt BrZd BrStr1 Sportivo Luqueño2 1 1 0 6,5 4 22 Club Olimpia2 1 0 1 5 4 33 12 de Octubre Itaugua2 1 1 0 5 2 14 Atlético Colegiales2 0 0 2 0 0 4
1/2 finału Data Mecz7 listopada 1999 Cerro Porteño – Sportivo Luqueño 1:1, karne 4:37 listopada 1999 Club Olimpia – Cerro Corá Asunción 0:1
Finał Data Mecz14 listopada 1999 Cerro Corá Asunción – Cerro Porteño 0:3Campos, Alvarenga, Cohener21 listopada 1999 Cerro Porteño – Cerro Corá Asunción 2:1Cohener, Román – Pérez k
Zwycięzcą turnieju Clausura w roku 1999 został klub Cerro Porteño
Campeonato Paraguay 1999 Paragwaj miał prawo wystawić w Copa Libertadores 2000 trzy kluby. Pierwsze dwa miejsca otrzymał mistrz i wicemistrz kraju, a o trzecie miejsce rozegrano baraż.