Ostatecznie wykryto fragmenty plazmidów bakteryjnych w komórkach roślin-gospodarzy, co potwierdziło, że to ten materiał genetyczny odpowiada za genetyczny efekt infekcji.
Wraz z odkryciem plazmidu Ti przeprowadzono liczne badania mające na celu określenie cech tego plazmidu oraz mechanizmu przenoszenia materiału genetycznego z bakterii z rodzaju Agrobacterium do rośliny-gospodarza. Do najważniejszych wczesnych osiągnięć należą mapowanie plazmidu Ti w 1978 r. oraz analiza podobieństw sekwencji między różnymi plazmidami Ti w 1981 r.
W latach 1980–2000 prowadzono badania mające na celu scharakteryzowanie regionu T-DNA oraz regionu vir. Badania nad regionem T-DNA pozwoliły ustalić mechanizm jego transferu oraz zidentyfikować geny odpowiedzialne za syntezę hormonów roślinnych i opinów. W odrębnych, wczesnych badaniach starano się określić funkcje genów regionu vir; zwykle klasyfikowano je jako geny uczestniczące w interakcjach bakteria–gospodarz oraz jako geny biorące udział w przenoszeniu T-DNA.