Początkowo 14 Armia posuwała się w kierunku północnym, dążąc do odcięcia odwrotu Armii Kraków. 5 września 1939 otrzymała rozkaz marszu na północny wschód przez San na Lublin, gdzie miała wyjść na tyły polskich sił wycofujących się po zachodnim brzegu Wisły. 6 września zajęła Kraków. Jej sztab został przesunięty do Bielska. 11 września jej XVII Korpus i XVIII Korpus przekroczyły San na północ i południe od Przemyśla, wypierając polską 24 Dywizję Piechoty na wschód i skłaniając część oddziałów 11 Dywizji Piechoty do obsadzenia Twierdzy Przemyśl, po czym ruszyły na Lwów. 15 września 14 Armia zajęła Twierdzę Przemyśl, a 16 września została odparta spod Lwowa. W chwili wstrzymania ofensywy 19 września zajmowała przyczółki pod Kockiem i Zamościem. Między 17 a 27 września wzięła udział w dwufazowej bitwie pod Tomaszowem Lubelskim. Do 29 września wycofała się za San.
Po zakończeniu działań wojennych okupowała część Lubelszczyzny z Krasnystawem i Zamościem.
W październiku 1939 przerzucona na zachód i przemieniona w 12 Armię. Ponownie utworzona w listopadzie 1943 roku, walczyła na terenie Włoch w składzie Grupy Armii C aż do 2 maja 1945 roku, kiedy to skapitulowała.