Niniejszym uznaję szkołę tę za państwową i pragnę, aby młodzież miała zawsze przed oczyma najwyższy wzór rozumu państwowego, cnoty obywatelskiej, rycerskiego honoru, niezłomnej służby i poświęcenia dla ojczyzny, nadaję szkole nazwę: Królewsko Polskie gimnazyum imienia Żółkiewskiego".
W latach 20. XX wieku szkoła działała jako Państwowe Gimnazjum im. Hetmana Stanisława Żółkiewskiego. W 1923 r. ze szkoły wydzielono Gimnazjum im. Bolesława Prusa. Okres międzywojenny był czasem największego rozkwitu szkoły, absolwenci stanowili wtedy elitę intelektualną Siedlec. W czasie II wojny światowej prowadzono tajne nauczenie.
W 1961 r. władze zamknęły gimnazjum argumentując to reformą szkolnictwa. W 1991 r. reaktywowano działalność szkoły jako liceum.
W latach 2018–2019 budynek liceum przeszedł gruntowny remont. Przebudowano istniejący, historyczny budynek szkoły, wybudowano nową część z łącznikiem i nowymi salami oraz zburzono stare budynki znajdujące się na terenie szkoły. Planowana była również budowa hali sportowej, lecz do tej inwestycji nie doszło.