Inne zastosowania W Arecibo przeprowadzano naziemne doświadczenia aeronomiczne wspierane przez NASA, m.in. Coqui 2. Teleskop był również wykorzystywany przez wywiad Stanów Zjednoczonych do określania pozycji stacji radarowych ZSRR na podstawie sygnałów odbitych od Księżyca. W 1974 roku przy jego pomocy wyemitowano w kierunku Gromady Herkulesa wiadomość skierowaną do potencjalnych obcych. Był głównym źródłem danych dla projektu poszukiwania cywilizacji pozaziemskich SETI@home.
Lista dyrektorów 1960–1965 – dr William E. Gordon (Cornell University) 1965–1966 – dr John W. Findlay (University of Cambridge) 1966–1968 – dr Frank Drake (Harvard University) 1968–1971 – dr Gordon Pettengill (Uniwersytet Kalifornijski w Berkley) 1971–1973 – dr Tor Hagfors (Uniwersytet w Oslo) 1973–1982 – dr Harold D. Craft Jr. (Cornell University) 1982–1987 – dr Donald B. Campbell (Cornell University) 1987–1988 – dr Riccardo Giovanelli (Uniwersytet Boloński) 1988–1992 – dr Michael M. Davis (Uniwersytet w Lejdzie) 1992–2003 – dr Daniel R. Altschuler (Brandeis University) 2003–2006 – dr Sixto A. González (Utah State University) 2006–2007 – dr Timothy L. Hankins (University of California, San Diego) 2007–2008 – dr Robert B. Kerr (University of Michigan) 2008–2011 – dr Michael C. Nolan (University of Arizona) 2011–2015 – dr Robert B.