Zmarł na atak serca, przypisywany reperkusjom, jakie go spotkały, gdy opublikował artykuł krytyczny wobec teorii Hitlera.
Jego głównym dziełem pozostają wydane pośmiertnie Grundzüge der Phonologie (Podstawy fonologii). Zawarł tam m.in. swoją słynną definicję fonemu jako najmniejszej jednostki dystynktywnej w obrębie danego języka. Jego praca miała zasadnicze znaczenie dla ugruntowania statusu fonologii jako dziedziny odrębnej od fonetyki.
Trubieckoj był również krytykiem literackim. Analizował literaturę rosyjską, poczynając od staroruskiego eposu Słowo o wyprawie Igora (Igor Lay), a kończąc na XIX-wiecznej poezji rosyjskiej i Dostojewskim.
Bibliografia Stephen R. Anderson. 1985. Phonology in the Twentieth Century. Theories of Rules and Theories of Representations. Chicago: The University of Chicago Press. pp 83-116. Nikolaj Trubeckoj. 1922. Essay sur la chronologie de certains faits phonétiques du slave commun. Nikolaj Trubeckoj. 1929. Polabische Studien. Nikolaj Trubeckoj. 1934. Das morphonologische System der russischen Sprache. Nikolaj Trubeckoj. 1939.