Na początku lipca 2012 zawodnik podpisał roczną umowę z klubem Dallas Stars. Od września 2012 do stycznia 2013 na okres lokautu w sezonie NHL (2012/2013) związał się z macierzystym HC Kladno (wraz z nim inni wychowankowie klubu, Tomáš Plekanec i Jiří Tlustý). 2 kwietnia 2013 został zawodnikiem Boston Bruins i pozostawał nim do końca sezonu (z drużyną dotarł do finału rozgrywek). W lipcu 2013 został zawodnikiem New Jersey Devils. Pod koniec kwietnia 2014 przedłużył kontrakt o rok. Od końca lutego 2015 zawodnik Florida Panthers. W kwietniu przedłużył kontrakt z klubem o rok. Po dwóch sezonach w barwach tej drużyny odszedł z Floridy w połowie 2017. Na początku października 2017, w wieku 45 lat związał się rocznym kontraktem z pierwszym w swojej karierze klubem kanadyjskim, Calgary Flames. 29 stycznia 2018 ogłoszono jego wypożyczenie do macierzystego HC Kladno (występującego w 1. lidze), a wkrótce potem poinformowano o możliwości równoległych występów Jágra w zespole Oceláři Trzyniec (grającego w ekstralidze). Sam zawodnik przyznał, że w barwach Trzyńca jest skłonny grać dopiero w decydujących meczach sezonu. W pierwszym spotkania w barwach Kladna 3 lutego 2018 zaliczył trzy asysty.