Szczęśliwym zbiegiem okoliczności, Ben znajduje w końcu Scuddera i prowadzi go do Belyakova, który zmusza go do wyjawienia prawdziwej tożsamości antagonisty Bena, który... okazuje się być synem Belyakova, Aleksiejem (Justin i jego siostra zostali wychowani przez duchownego Normana Balthusa i otrzymali nowe imiona po matce – żona Belyakova zginęła w katastrofie pociągu. Belyakov atakuje Scuddera, co zmusza Bena do zabicia Rosjanina. W tym momencie cała wiedza i moc Belyakova przechodzą na Bena, który kontynuuje poszukiwania swojego wroga.
Drugi sezon kończy się dramatyczną konfrontacją pomiędzy Benem a Bratem Justinem w polu na obrzeżach New Canaan w Kalifornii.
Serial łączy teologię chrześcijańską z wątkami gnostycznymi i masońskimi, szczególnie tymi odnoszącymi się do Templariuszy.