Wówczas Joss Whedon został poproszony o napisanie i wyreżyserowanie nowej wersji Batmana: Roku pierwszego. Whedon ujawnił, że jego wersja była kameralna i skupiał się na świeżo osierocony Brusie będącym ponurym, zafiksowanym na śmierci dzieciaku. Przełomem był moment, gdzie 12-letni Bruce skutecznie broni dziewczynkę przed prześladowcami w alejce, takiej samej, w jakiej zamordowano jego rodziców i zdaje sprawę, że jest w stanie powstrzymać zło. W opinii Whedona był to „moment, w którym odnajduje cel, zamiast po prostu być przytłoczonym żałobą po śmierci rodziców”. Whedon stworzył nowego złoczyńcę na potrzeby filmu, postać w stylu Hannibala Lectera, którą Wayne odwiedziłby w Azylu Arkham, aby dowiedzieć się czegoś o umyśle przestępcy. Warner Bros. nie zdecydowało się na współpracę z Whedonem. Zamiast tego w styczniu 2003 roku zwrócili się do brytyjskiego scenarzysty i reżysera Christopher Nolana, który właśnie odniósł sukces dzięki filmowi Memento (2000).
Scenariusz