W marcu, gdy raniony został Georges Guynemer, Navarre stał się przejściowo czołowym francuskim asem myśliwskim. W dniu 24 kwietnia zestrzelił jeden samolot na pewno i trzy prawdopodobnie. W kwietniu został też promowany na stopień Sous-Lieutenant. Latał wówczas myśliwcem Nieuport 11 lub Nieuport 16. 19 maja został zestrzelony, lecz zdołał wylądować uszkodzonym samolotem.
17 czerwca 1916 roku Navarre zestrzelił w parze dwunasty samolot, ale sam został zestrzelony w ataku na kolejny samolot rozpoznawczy nad Argonnamie. Odniósł tym razem poważne rany w lewą rękę i bok, lecz zdołał awaryjnie wylądować. Mimo odzyskania fizycznej sprawności, Navarre przeżył załamanie nerwowe. W dodatku w tym czasie 15 listopada 1916 roku zginął jego brat bliźniak Pierre, także lotnik. Dopiero po dwóch latach leczenia i rehabilitacji, powrócił w 1918 roku do latania, lecz nie będąc w pełni sprawnym, nie uczestniczył już w lotach bojowych. We wrześniu 1918 roku został pilotem fabrycznym zakładów Morane-Saulnier.