Za czasów tyranii Pizystratydów mały|Nowożytna mapa części Attyki, z zaznaczonym położeniem Lejpsydrionu (na północ od Aten) W okresie rządów Pizystratydów Alkmeonidzi występowali przeciwko nim i tyranii w Atenach. Nie zawsze jednak postępowali w ten sposób, wybierali także współpracę z Pizystratem i otrzymywali od niego urzędy, lecz niezadowolenie z pozycji, jaką im przeznaczał w rządzonych przez siebie Atenach, prowadziła do kolejnych zbrojnych wystąpień; .. Megakles, syn Alkmeona, przewodził stronnictwu „mieszkańców wybrzeża” podaje, że składało się z obywateli trudniących się rzemiosłem i kupiectwem. i w porozumieniu z rodem Eteobutadów doprowadził do wygnania tyrana. Gdy jednak poróżnił się z dotychczasowymi sprzymierzeńcami, umożliwił mu powrót, co prawda krótkotrwały, bowiem szybko doszło między nimi do konfliktu jako datę tych wydarzeń podaje rok 556.; ..
Niechęć do Pizystrata, który ostatecznie powrócił do władzy w Atenach, tłumaczy się zadawnioną zawiścią, niewykluczone, że któryś z Alkmeonidów sam miał ambicję, by samodzielnie przejąć władzę nad polis..