- zakonnicy starając się ukryć kosztowności ukryli garniec z 1084 drobnymi monetami pod posadzką prezbiteriumOdkryli go archeolodzy kierowani przez dr Arakdiusza Koperkiewicza..
W połowie XVII w. zaczął rozwijać się w Barczewie kult św. Antoniego. Biskup Wacław Leszczyński wsparł rozbudowę dawnej kaplicy Batorych, która otrzymała wówczas wezwanie św. Antoniego. W 2 poł. XVII w. doszło do fundacji nowych ołtarzy - mariackiego i św. Antoniego oraz budowy empory organowej.
Istotne zmiany w architekturze wnętrza świątyni przyniosły czasu saskie. W latach 1732-36 Jan Chrystian Schmidt wzniósł ołtarz główny fundowany z pieniędzy rajcy Jana Zilta (Citta). Ten sam rzeźbiarz w latach 1736-1748 wykonał jeszcze pięć ołtarzy boczne. Natomiast jego syn - Christian Bernard Schmidt, niedługo po przejęciu warsztatu ojca, w 1766 r. zbudował dla kościoła ambonę (była to czwarta ambona w kościele: po dwóch gotyckich i manierystycznej)P. Samól, Kościół św. Andrzeja w Barczewie..., s. 156-165.. W latach 80. XVIII w. przebudowa elewację zachodnią w stylu późnobarokowym (architekt: Ernst Mahsur)A. Rzempołuch, Przewodnik po zabytkach sztuki dawnych Prus Wschodnich, Olsztyn 1992, s. 107.;