Płk Henderson został oskarżony o brak reakcji (leciał w helikopterze nad wioską i widział przebieg masakry) oraz mataczenie w śledztwie, ostatecznie zarzuty przeciwko niemu wycofano.
Dochodzenie prowadzone przez generała Williama Peersa wykazało, że w masakrę zamieszanych było 28 oficerów, w tym 2 generałów i 4 pułkowników, oskarżonych o 224 naruszenia prawa wojskowego, m.in. składanie fałszywych zeznań, zatajanie informacji oraz utrudnianie śledztwa. Ostatecznie jedyną osobą skazaną za zbrodnię pozostawał Calley. Dowódca 23. Dywizji, gen. brygady Samuel Koster, został zdegradowany, ale nie poniósł innej kary. Kapitan Ernest Medina, dowódca kompanii C, został uniewinniony.
Por. William Calley został w 1971 roku skazany na karę dożywotniego więzienia za masowe morderstwo, jednak już dwa dni później prezydent Richard Nixon skorzystał z prawa łaski i nakazał wypuścić go z więzienia. Ostatecznie Calley otrzymał 3,5 roku aresztu domowego w swojej kwaterze w Fort Benning w stanie Georgia.