Konstrukcja Dornier Do 215B-3 był dwusilnikowym samolotem w układzie grzbietopłata o konstrukcji metalowej z chowanym podwoziem. Kadłub o konstrukcji półskorupowej, zbudowany w oparciu o podłużnice i elementy usztywniające oraz 33 wręgi. Dwie pierwsze wręgi stanowiły ramę oszklenia kabiny załogi. Kadłub był podzielony na trzy sekcje: kabinę załogi, sekcję skrzydłową oraz końcówkę kadłuba. Z przodu kabiny znajdowało się miejsce nawigatora, który jednocześnie pełnił funkcję przedniego strzelca. Za nawigatorem miejsce zajmował pilot, który sterował samolotem z wykorzystaniem wolantu oraz pedałów. Dalej znajdowały się stanowisko tylnego strzelca oraz radiostacja pokładowa. Za kabiną załogi był umiejscowiony główny zbiornik paliwa. Wręgi 11. i 13. były wzmocnione i pełniły rolę przegród ogniowych. Pomiędzy wręgą 13. a 14. umieszczono sześć zbiorników z tlenem, między 20. a 21. znajdował się kompas. Pokrycie było wykonane z blachy nitowanej do elementów konstrukcyjnych kadłuba. Załoga wchodziła na pokład samolotu przez właz umieszczony obok dolnego stanowiska strzeleckiego.