W latach 1950–1954 klub występował jako Ogniwo Częstochowa. Był to wówczas branżowy klub rzemieślników. W grudniu 1954 roku klub zmienił nazwę na Sparta Częstochowa, a w marcu 1955 powrócił do nazwy Skra. W latach 1953–1966 Skra występowała w rozgrywkach o mistrzostwo III ligi.
3 lutego 1974 roku doszło do fuzji Skry i Barbary i do 17 grudnia 1978 roku funkcjonował Międzyzakładowy Robotniczy Klub Sportowy Skra-Barbara Częstochowa. Patronami klubu był wówczas Zakład Energetyczny oraz Częstochowska Fabryka Urządzeń Mechanicznych. W latach 1978–1983 klub sponsorowała firma Komobex..
Do 1994 roku klub brał udział w rozgrywkach III i IV ligi. W czerwcu 2001 roku drużyna seniorów została ponownie zgłoszona do rozgrywek. 25 marca 2010 roku założono spółkę Akcyjną Klub Sportowy Skra Częstochowa. W sezonie 2010/2011 drużyna wygrała Puchar Polski w podokręgu Częstochowa. 3 sierpnia 2011 doszło do fuzji Skry Częstochowa z LKS Orzeł Psary Babienica. Na mocy zawartego porozumienia Skrze przekazano sekcję piłki nożnej Orła składającą się z dwóch drużyn seniorskich i dwóch drużyn młodzieżowych. Ponadto zajęła ona miejsce Orła w III lidze. W następnym sezonie 2011/2012 zespół Orła Babienica wystąpił w rozgrywkach lublinieckiej A klasy.