Prawnym następcą pierwszej frankfurckiej Viadriny jest dzisiejszy Uniwersytet Wrocławski (poprzez niemiecki Schlesische Friedrich-Wilhelms-Universität), a do tradycji uczelni nawiązuje założony w 1991 Uniwersytet Europejski Viadrina we Frankfurcie nad Odrą.
Herb Uniwersytetu Herbem Viadriny frankfurckiej i wrocławskiej (niemieckiego Uniwersytetu Wrocławskiego, w latach 1506–1945) była Madonna na półksiężycu, czyli Immaculata (niem. Mondsichelmadonna).
Rektorzy Konrad Wimpina (Konrad Koch) (1460–1531), organizator (1505–1506) i rektor-założyciel (1506) (ok. 1470–1540) Johann II. von Blankenfelde (Johann Blankenfelde) (1471–1527) Gregor Günther († 1519) Urban Pierius (1546–1616), rektor od 1577 Ludolph Schrader (1531–1589), rektor 1559, 1568, od 1579 Erdmann Kopernikus († 1573) Johann Knobloch (1520–1599) Jacobus Bergemann († 1595) Heinrich Wenzel von Münsterberg (1592–1639), rektor 1608 (1592–1642) 1629 (1608–1672) WS 1638, 1649, 1655, 1669 Johann Christoph Bekmann (1641–1717), rektor 1672 Bernhard Albinus (1653–1721), rektor 1687 (1664–1727) Christian Gottfried Hoffmann (1692–1735), rektor 1722 Johann Lorenz Fleischer (1689–1749), rektor 1744–1749 Johann Samuel Friedrich von Böhmer (1704–1772), rektor 1750, 1759, 1769 Joachim Georg Darjes (1714–1791), rektor 1772, 1779, 1788 Christian Ernst Wünsch