Pozycja systematyczna według APweb (aktualizowany system APG IV z 2016) W kolejnych wersjach systemów APG rodzina makowatych zaliczona jest do rzędu jaskrowców (Ranunculales), kladu dwuliściennych właściwych (eudicots). Makowce są grupą siostrzaną dla niemal wszelkich pozostałych przedstawicieli rzędu jaskrowców z wyjątkiem olszankowatych (Eupteleaceae).
Podział rodziny Rodzina makowatych obejmuje dwie linie rozwojowe w randze podrodzin, które przez niektórych autorów wyróżniane są w randze rodzin (np. system Cronquista z 1981). Podział taksonomiczny rodziny:
Podrodzina Papaveroideae Eaton (rodzina Papveraceae sensu stricto)
Plemię Papavereae Dumortier – 11 rodzajów na półkuli północnej, w Ameryce Południowej i na południowym krańcu Afryki, Arctomecon Torr. & Frém. Argemone L. – argemon Canbya Parry ex A. Gray Meconella Nutt. Meconopsis Vig. – mekonops Papaver L. – mak (w tym Stylomecon G. Taylor) Platystemon Benth. – platystemon Platystigma Benth. Roemeria Medik. – remeria Romneya Harv.