Niemal natychmiast władze spółki podchwyciły ową ideę tym bardziej, że inicjator pomysłu pełnił w niej funkcję Dyrektora Zarządzającego.
Pierwsze faktyczne działania podjęto już wiosną 2006, gdy koncepcję powołania ligi młodzieżowej konsultowano z klubami, a pomysł zaaprobował Prezes Zarządu Ekstraklasy SA – Andrzej Rusko. Latem 2006 zaprezentowano ostateczny projekt rozgrywek, który 15 lutego 2007 został zatwierdzony przez kluby, co było równoznaczne z utworzeniem Młodej Ekstraklasy. Tego samego dnia uroczyście ogłoszono start nowych rozgrywek począwszy od sezonu 2007/2008, jednak wszelkie procedury prawne zakończono dopiero 10 lipca 2007 zatwierdzeniem regulaminów przez Polski Związek Piłki Nożnej. Mimo wszystko już w maju 2007 władze Widzewa Łódź podjęły decyzję o nieutworzeniu drużyny młodzieżowej, co oznaczało brak możliwości startu w MESA. Niemal od razu pojawiło się kilka pomysłów na zapełnienie luki i dokooptowanie do ligi zespołu innego klubu. W grę wchodził któryś z drugoligowców, a najbardziej zainteresowany był GKS Katowice. Ostatecznie jednak zadecydowano o pozostawieniu nieparzystej liczby klubów, co wiązało się z koniecznością pauzowania przez jedną z drużyn w każdej kolejce.